Dopo l'imprigionamento di Ganondorf nel Sacro reame, la pace ritorna su Hyrule... ma Link non riesce a trovare più Navi, la sua fedele amica. Tendando di cercarla nella foresta, il nostro eroe si imbatte nel perfido Skull Kid, che gl ruba l'Ocarina del Tempo e lo trasforma in un Deku Scrub! Per sistemare le cose, questa volta Link dovrà intraprendere un viaggio straordinario in un mondo parallelo: lì incontrerà nuovi amici, ma anche nuovi nemici!
Una delle epopee videoludiche più amate della storia diventa un manga dedicato a tutti gli amanti dell'avbventura, che porta la magia della saga di THE LEGEND OF ZELDA in un mondo di carta e inchiostro.