Nel bel mezzo dell’epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica, conquistano la Terra. La casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada, che considerano la loro stessa anima. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo, che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i principi del vero samurai…
Kagura si ritrova coinvolta in una lite sanguinosa tra alieni del suo popolo, mentre Gintoki comincia a combattere contro il “re della notte” Hosen. I due tuttofare sembrano in seria difficoltà! A quale sorte andranno incontro Seita, Hinowa e l’intero quartiere Yoshiwara?!