Nel bel mezzo dell'epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica e conoscitiva, conquistano la Terra. La casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada, che considerano la loro stessa anima. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i principi del vero samurai...
Possibile che Gin-san abbia un figlio illegittimo?! Lasciato misteriosamente davanti all'Agenzia Tuttofare, fa la sua comparsa Gintoki Jr.! Ma questo non pone un freno ai nostri scavezzacollo, che partono alla frenetica ricerca di un ventilatore e arrivano a mettere in gioco persino la vita! Per non parlare della loro partecipazione alla tradizionale prova di coraggio del quartiere e della sfida con gli shinsengumi nel collezionare insetti...