Nel bel mezzo dell'epoca Edo, quella dei grandi samurai, piombano dal cielo degli alieni che si fanno chiamare Amanto, i quali, forti della loro superiorità tecnologica e conoscitiva, conquistano la Terra. Il mondo viene stravolto: la casta dei samurai viene abolita e i nobili guerrieri privati della spada che considerano la loro stessa anima. Tuttavia, qualcuno non è disposto ad accettare questa imposizione: si tratta di Gintoki Sakata, ragazzaccio ribelle e impulsivo che con un gruppo di amici cerca di tirare avanti senza tradire i nobili principi del vero samurai…
Questa volta Gintoki e i suoi amici finiscono in un'arena sotterranea dove si scommette sui combattimenti illegali tra samurai! La proposta che ricevono è di annientare l'organizzazione clandestina che gestisce gli incontri... Oltre a ciò, quali altri assurdi compiti attenderanno il trio "tuttofare"?!